吐鲁番郡王府据史科考证始建于清朝乾隆年间，距今已有300年的历史，是吐鲁番郡王额敏和卓生活和主持政务、指挥军事的地方，也是清王朝期间吐鲁番维吾尔族的政治、经济、文化和军事指挥的中心。其主人额敏和卓不仅是当时吐鲁番维吾族的领袖、清政府的参赞大臣，也是一位杰出的爱国者和军事家。

吐鲁番郡王府在1933年被盛世才的军队放火烧毁。现在的郡王府是根据史料记载基本按以前的维吾尔族建筑风格、布局和规模恢复兴建的。现在的郡王府占地面积22亩，宫殿建筑面积约二千五百平方米。郡王府大门及院墙造型别具一格，庄重、古朴大方具有浓郁的伊斯兰风格。郡王府院内、前后宫殿共有大小房间数十间，天棚、拱廊、楼梯、栏杆和檐口用典型的维吾尔民族工艺进行雕刻，配以石膏花饰，极具民族风味；庭院种植的各种果树和葡萄树郁郁葱葱。